完成了整體的實(shí)驗室建設，在確保人員、設備、環(huán)境、方法、試劑等消耗性材料、樣品等均符合要求后，實(shí)驗室還應該對檢測過(guò)程進(jìn)行控制，確保影響檢測結果的因素全部受控。

實(shí)驗室檢測過(guò)程的控制，首先要嚴格依據有關(guān)標準、規范、作業(yè)指導書(shū)實(shí)施檢測。確保各項操作由授權人員依據文件規定執行。除此之外，實(shí)驗過(guò)程中，應采取一些措施，確保檢測結果的準確性和有效性。

以化學(xué)實(shí)驗室建設運行為例： 

（1） 空白 

試劑空白一般每制備批樣品或每20個(gè)樣品做一次，樣品的檢測結果應消除空白造成的影響。高于接受限的試劑空白表示與空白同時(shí)分析的這批樣品可能受到污染，檢測結果不能被接受。當經(jīng)過(guò)實(shí)驗證明試劑空白處于穩定水平時(shí)，可適當減少空白試驗的頻次。當檢測方法對空白有具體規定時(shí),應滿(mǎn)足方法要求。 

（2） 實(shí)驗室控制樣品 

實(shí)驗室控制樣品(LCS)可每制備批樣品或每20個(gè)樣品做一次。LCS應按通常遇到的基體和含量水平準備，其測定結果可建立質(zhì)量控制圖進(jìn)行分析評價(jià)。當經(jīng)過(guò)LCS測試實(shí)驗證明檢測水平處于穩定和可控制狀態(tài)下，可適當減少LCS的測試頻率。 

（3） 加標 

應在分析樣品前加標，基體加標應至少每制備批樣品或每個(gè)基體類(lèi)型或每20個(gè)樣品做一次，且添加物濃度水平應接近分析物濃度或在校準曲線(xiàn)中間范圍濃度內，加入的添加物總量不應顯著(zhù)改變樣品基體。 

（4） 重復檢測 

重復樣品一般至少每制備批樣品或每個(gè)基體類(lèi)型或每20個(gè)樣品做一次。當經(jīng)過(guò)試驗表明檢測水平處于穩定和可控制狀態(tài)下，可適當地減少重復檢測頻率。